Instale OpenJDK para obter todos os cabeçalhos que javabridge compila:
$ sudo apt-get install default-jdk
No meu ubuntu 14.04 tive problemas com dependência, acabei instalando o java da oracle seguindo as orientações deste site: [instalando java da oracle](http://askubuntu.com/questions/521145/how-to-install-oracle-java-on-ubuntu-14-04)
Finalmente você pode usar pip para instalar os pacotes Python que não estão disponíveis no repositório:
$ sudo pip install javabridge
$ sudo pip install python-weka-wrapper
### Windows
Por favor note: você precisa certificar-se que os bits do seu ambiente é consistente. Isto é, se você instalar uma versão de Python 32-bit você deve instalar um JDK 32-bit e numpy 32-bit ( ou então todos eles devem ser 64-bit ).
Realize os seguintes passos:
Instale Python, esteja certo que você checou Add python.exe to path durante a instalação
Adicione os scripts Python eu sua variável de ambiente PATH, por exemplo, :\\Python27\\Scripts